Тыкву и филе нарежьте небольшими кусочками. Порубите лук и перец, измельчите чеснок.
Растопите в сковороде 20 г сливочного масла. Выложите половину лука и чеснока, перец, тыкву и листья тимьяна. Перемешайте и жарьте 15 минут под крышкой. Приправьте солью и чёрным перцем.
В другой сковороде разогрейте растительное масло. Выложите курицу, оставшийся лук и чеснок. Посолите и поперчите. Жарьте 5–7 минут.
Освободите место в центре сковороды с курицей. Растопите там 50 г сливочного масла. Всыпьте муку и хорошо перемешайте с маслом.
Через минуту влейте молоко, всё тщательно перемешайте. Добавьте соль и перец. Доведите до кипения и снимите с огня.
Выложите в форму для запекания макароны, добавьте тыкву и соус с курицей. Перемешайте. Посыпьте тёртым сыром.
Поставьте в духовку, разогретую до 180 ℃, примерно на 30 минут.