Создатель The Binding of Isaac Эдмунд МакМиллен (Edmund McMillen) рассказал, что его культовый рогалик изначально был лишь экспериментом. По словам разработчика, игра появилась как способ «попробовать силы» в жанре перед созданием Mewgenics, которую он считал своим настоящим шедевром.
После успеха Super Meat Boy в 2010 году МакМиллен и его коллега Томми Рефенес (Tommy Refenes) из студии Team Meat начали планировать новый проект — Mew-Genics. Игру анонсировали в 2012-м, но уже через два года её отменили. Позже МакМиллен покинул студию, а в 2018 году выкупил права на проект и возобновил над ним работу — теперь уже под названием Mewgenics.
Пока Рефенес отдыхал после Super Meat Boy, МакМиллен решил «потренироваться» и создать небольшой прототип рогалика. «Я хотел сделать прототип ещё одного базового рогалика, чтобы попробовать себя в жанре перед большим проектом, который мы с Томми собирались создать», — рассказал девелопер в интервью NoClip. Спустя три месяца этот прототип превратился в The Binding of Isaac.
Рогалик про маленького Айзека неожиданно стал хитом. Игра получила ремейк The Binding of Isaac: Rebirth и спин-офф The Legend of Bum-Bo. Спустя более десяти лет проект остаётся живым — ежедневно в него заходят десятки тысяч геймеров.